在东京都心一座被阴雨终年笼罩的老旧公寓里，生活着一位名叫远藤莉邦的中年女性。她是一名专注于修复古籍的图书馆管理员，性格孤僻，生活如同她手中那些泛黄的纸张一样，按部就班且毫无波澜。然而，一场突如其来的暴雨打破了她平静的世界，也开启了一段名为“纯系迷宫”的离奇旅程。
故事始于莉邦在整理捐赠书籍时，意外发现了一本没有书名的皮革封皮日记。日记的笔迹属于一位与她容貌惊人相似的年轻女子，记录着她在二十年前于这座迷宫般的公寓楼中失踪前的最后时刻。更诡异的是，日记中描绘的公寓布局，与莉邦此刻身处的环境完全一致，甚至连墙上剥落的壁纸纹路都分毫不差。当莉邦试图查阅档案时，却惊恐地发现，关于这本日记和那个年轻女子的记录，在图书馆的数据库中竟完全消失，仿佛她们从未存在过。
随着调查的深入，莉邦开始意识到自己正步入一个由记忆与幻觉交织而成的纯系迷宫。这座迷宫并非物理意义上的建筑，而是由她内心深处被压抑的童年创伤与对自我身份的迷茫所构筑。每当她试图寻找出口，公寓的走廊便会无限延伸，房间的门牌号码会不断重组，甚至会出现无数个“自己”在镜中对视。每一个“莉邦”都拥有不同的人生片段：有的选择了逃离东京，有的成为了著名作家，而有的则永远被困在了那个雨夜。
在迷宫的深处，莉邦终于见到了日记的主人。原来，那个年轻女子并非别人，正是莉邦在平行时空或深层潜意识中的另一个自我。她为了逃避一场惨痛的家庭变故，在二十年前主动切断了与现实世界的联系，将自己封锁在了这个由执念构建的迷宫之中。而现实中的莉邦，其实早已在多年前的某个瞬间“死”去，现在的她不过是这个迷宫为了维持运转而投射出的幻影，是那个年轻女子为了填补内心空洞而创造出的“容器”。
剧情的高潮发生在迷宫的顶端，那里有一扇通往真实世界的门，但门外是莉邦最恐惧的真相：她所珍视的回忆、她的工作、甚至她所爱的人，都是那个年轻女子为了自我救赎而编织的谎言。如果走出这扇门，意味着她必须面对残酷的现实，接受自己从未真正活过的事实；如果留在迷宫，她将永远在虚假的完美中沉沦。在雨声与心跳声交织的轰鸣中，莉邦做出了选择。
她没有推开那扇门，而是转身走向迷宫的中心，将日记合上。她意识到，所谓的“纯系迷宫”并非囚笼，而是她灵魂自我疗愈的必经之路。她接纳了那个年轻女子的痛苦，也接纳了那个虚构自我的存在。当第一缕阳光穿透厚重的云层照进公寓时，迷宫开始崩塌，墙壁化作尘埃，无数扇门同时打开。莉邦站在废墟之上，虽然世界变得陌生而荒凉，但她的眼神中却前所未有的清澈与坚定。她终于明白，无论身处何种迷宫，只要内心拥有直面真实的勇气，就能在废墟中重建属于自己的生活。影片在莉邦独自走向街头的背影中缓缓落幕，留给观众无尽的思考：我们究竟是在寻找出口，还是在寻找真实的自己？
